MCP Simple PubMed

一个通过 Entrez API 提供对 PubMed 文章访问的 MCP 服务器。

<a href="https://glama.ai/mcp/servers/5wlfb8i6bj"><img width="380" height="200" src="https://glama.ai/mcp/servers/5wlfb8i6bj/badge" alt="mcp-simple-pubmed MCP server" /></a>

特性

• 使用关键词搜索 PubMed 数据库
• 访问文章摘要
• 下载全文（适用于 PubMed 上直接提供的开放获取文章）

请注意，该工具返回全文的 XML 格式版本。 然而，对于人工智能来说，这比“人类可读”的文本更有用，因为它提供了关于文档结构的额外信息。 至少，Claude 3.5 Sonnet 表示它更喜欢这种格式。

另请注意，此工具以及可能其他工具无法提供论文全文，可能并非由于该论文不可用。 在测试此工具时，我遇到一篇在 PubMed 上没有全文的论文，当 Claude 使用 fetch 访问该出版物的 URL（我们通过 DOI 获得）时，它确实收到了“forbidden”错误。 但是，我可以使用常规浏览器访问完全相同的页面。

换句话说，如果您的 AI 助手无法使用此工具获取论文的全文，则值得使用常规 Web 浏览器手动尝试。

最后，当然，此工具无法让您访问付费/订阅的论文。 您可以通过您的图书馆访问权限阅读它们，或者 - 作为最后的手段 - 通过某个致力于免费提供公共资助研究的网站阅读它们。

安装

通过 Smithery 安装

要通过 Smithery 为 Claude Desktop 自动安装 Simple PubMed：

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手动安装

pip install mcp-simple-pubmed

配置

该服务器需要以下环境变量：

• PUBMED_EMAIL: 您的电子邮件地址（NCBI 要求）
• PUBMED_API_KEY: 可选的 API 密钥，用于更高的速率限制

标准速率限制为 3 个请求/秒。 没有实施速率限制，因为在典型的使用场景中，您的 AI 不太可能产生更多的流量。 如果您需要它，您可以注册一个 API 密钥，这将为您提供 10 个请求/秒。 在 NCBI 页面 上阅读有关此内容的信息。

与 Claude Desktop 一起使用

添加到您的 Claude Desktop 配置 (claude_desktop_config.json):

(Mac OS)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

(Windows)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

许可证

MIT 许可证