ChEMBL-MCP-Server

一个基于 chembl_webresource_client 包的 FastMCP 封装服务器，提供对 ChEMBL 数据库的 API 访问。

特性

• 完整的 ChEMBL 数据库 API 访问
• 使用 FastMCP 框架实现的异步 API 调用
• 内置错误处理和超时机制
• 支持 HTTP 和 stdio 传输方法
• 完整的类型注解和文档字符串

安装

# 克隆仓库
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt

使用

启动服务器

# 使用默认配置启动 HTTP 服务器
python chembl_searver.py

# 指定主机和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用 stdio 传输
python chembl_searver.py --transport stdio

# 设置日志级别
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

可用参数

• --host: 服务器主机地址，默认为 127.0.0.1
• --port: 服务器端口，默认为 8000
• --transport: 传输方法，选择 http 或 stdio，默认为 http
• --log-level: 日志级别，从 DEBUG, INFO, WARNING, ERROR, CRITICAL 中选择，默认为 INFO

API 函数

服务器提供以下 API 函数：

数据实体 API

• example_activity: 获取活性数据
• example_assay: 获取测定数据
• example_target: 获取靶标数据
• example_molecule: 获取分子数据
• example_drug: 获取药物数据
• 更多数据实体 API...

化学工具 API

• example_canonicalizeSmiles: 规范化 SMILES 字符串
• example_smiles2inchi: 将 SMILES 转换为 InChI
• example_smiles2svg: 将 SMILES 转换为 SVG 图像
• example_structuralAlerts: 获取结构警报
• 更多化学工具 API...

示例

查看 chembl_search.py 文件，了解使用各种 API 的示例。

依赖

• chembl_webresource_client: ChEMBL Web Service Client
• mcp: MCP Framework
• fastapi: FastAPI Framework
• uvicorn: ASGI Server
• asyncio: Asynchronous I/O Library

许可证

MIT